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Browse by clinical annotations We use the modules to obtain a global characterization of different conditions by a combination of activated and deactivated modules. Based on information provided in the respective studies, we annotated all arrays with 283 biological and clinical conditions that we compiled from the data published in the various studies. These annotations include tissue and tumor type, diagnostic and prognostic information, and molecular markers. For each module and each condition, we tested whether the module is induced (repressed) in a significant fraction of the arrays labeled with the condition. Clinical annotation Modules 0.5hr immune stimulation (Stimulated PBMC) 522 1X dose immune stimulation (Stimulated PBMC) 197 252 Activated B like DLBCL (B lymphoma) 1 2 5 6 12 16 23 24 27 33 38 44 45 46 52 53 55 60 63 64 73 75 76 79 84 85 88 92 97 107 108 117 118 121 122 128 134 145 146 164 169 170 171 172 174 182 188 199 208 209 212 220 223 241 259 263 265 288 289 292 300 301 311 345 358 361 367 375 399 433 436 522 562 Acute leukemia (Leukemia*) 1 2 5 6 11 12 14 19 27 33 38 44 45 46 47 63 64 65 66 75 76 80 84 85 88 92 94 99 100 105 112 117 119 120 122 123 129 137 138 146 165 171 173 174 175 176 199 200 204 213 214 216 220 241 244 247 248 259 267 287 289 291 292 301 316 328 330 340 341 345 362 375 407 411 416 424 433 436 444 445 448 453 456 465 470 478 489 500 516 539 540 557 560 Acute lymphocytic leukemia - ALL1 sub class (Leukemia) 341 Acute lymphocytic leukemia (Leukemia) 2 5 6 12 16 19 23 24 33 38 45 46 47 55 60 64 75 76 79 84 88 96 98 104 107 108 109 112 113 122 128 146 154 165 170 172 174 175 176 180 181 198 200 209 216 220 234 241 247 252 263 267 287 289 291 297 316 321 324 328 330 342 357 375 410 426 474 Acute lymphocytic leukemia - MLL sub class (Leukemia) 345 Acute lymphocytic leukemia - relapse (Leukemia) 287 Acute myelogeous leukemia (Leukemia) 8 13 17 36 41 54 57 72 98 119 124 145 188 197 198 204 238 244 252 301 Adenocarcinoma (Breast cancer*) 1 2 6 11 12 23 24 26 27 33 44 46 47 55 63 64 66 67 75 84 88 99 100 107 112 117 122 129 137 139 147 154 166 171 172 176 180 192 195 205 206 207 208 209 211 220 234 256 279 284 285 297 324 325 334 342 345 356 357 366 389 418 427 436 448 453 467 480 513 544 567 Adenocarcinoma - extrapulmonary metastasis (Lung cancer) 93 Adenocarcinoma (Liver cancer) 1 2 5 6 12 17 18 19 23 24 27 38 40 41 43 44 45 46 47 54 55 57 60 63 64 66 75 76 79 84 88 90 92 93 99 100 106 112 117 121 122 129 135 137 146 154 171 176 190 198 199 200 208 209 212 220 223 234 235 239 252 259 263 287 289 292 297 324 342 375 397 474 481 495 544 Adenocarcinoma (Lung cancer) 11 66 100 137 139 154 180 297 357 438 533 Adenocarcinoma - metastasis (Lung cancer) 280 Adenocarcinoma (Prostate cancer) 32 83 114 151 Adenocarcinoma (Various tumors) 123 177 274 322 After doxorubicin chemotherapy (Breast cancer) 5 6 55 75 88 107 122 172 176 208 342 436 Atypical teratoid/rhabdoid tumour - CNS and other origin (Neuro tumors) 3 8 17 18 28 32 35 41 50 52 63 83 86 91 94 102 104 105 110 111 113 114 115 129 149 151 155 157 159 181 219 245 248 299 316 321 363 379 447 B cells (B lymphoma*) 21 37 57 61 69 70 79 97 98 102 105 119 120 124 126 128 133 134 136 138 145 156 169 170 171 174 175 179 182 188 198 201 202 204 208 214 219 237 238 240 241 244 252 254 255 261 277 291 292 300 301 303 308 312 313 315 317 329 345 358 361 378 387 399 403 436 439 451 456 459 501 512 513 522 525 532 537 547 562 B cells (Leukemia) 1 2 5 6 12 19 23 24 33 36 38 45 46 47 51 55 60 63 64 75 76 79 80 84 85 88 90 92 96 99 104 107 109 112 113 121 122 128 139 146 154 170 172 174 176 180 181 199 200 209 214 216 220 234 242 247 248 259 262 263 267 287 289 297 315 316 324 328 330 341 357 375 379 410 411 426 433 474 501 563 B cells (Various tumors) 1 2 3 6 8 12 19 23 24 38 47 52 60 72 119 122 143 154 164 177 206 292 293 297 321 324 342 345 357 373 436 557 Bone marrow (Leukemia) 19 23 24 38 51 55 60 63 76 79 80 85 88 92 96 99 104 107 109 121 122 127 128 131 139 146 170 172 180 181 189 199 200 209 212 216 220 223 242 247 248 259 263 267 280 287 289 315 316 324 328 340 341 372 379 410 411 426 433 440 474 501 B. petrussis 338 stimulated immune cells (Stimulated PBMC) 16 17 308 B. petrussis 537 stimulated immune cells (Stimulated PBMC) 3 8 16 17 18 44 46 52 54 57 75 107 145 188 212 238 244 280 301 361 403 451 B. petrussis A2 stimulated immune cells (Stimulated PBMC) 3 5 6 8 15 16 17 18 27 36 44 45 46 52 54 57 61 64 72 75 98 105 117 124 143 144 145 188 197 198 212 219 223 237 238 244 248 252 289 293 301 303 315 321 337 361 375 397 403 451 485 B. petrussis Minnesota 1 stimulated immune cells (Stimulated PBMC) 300 399 B. petrussis stimulated immune cells (Stimulated PBMC) 3 8 15 16 17 18 44 45 46 52 53 54 57 61 64 69 72 75 79 84 98 105 118 119 124 126 128 136 143 170 171 188 197 198 208 212 219 223 237 238 244 252 254 292 293 301 308 312 315 317 345 361 378 397 403 436 439 451 485 B. petrussis Tox 6 stimulated immune cells (Stimulated PBMC) 3 8 15 16 17 18 44 46 52 54 57 61 72 75 98 105 124 145 188 197 198 212 237 238 244 252 301 315 361 397 403 451 485 Breast cancer (Breast cancer*) 1 2 6 11 12 23 24 26 27 33 44 46 47 55 63 64 66 67 75 84 88 99 100 107 112 117 122 129 137 139 147 154 166 171 172 176 180 192 195 205 206 207 208 209 211 220 234 256 279 284 285 297 324 325 334 342 345 356 357 366 389 418 427 436 448 453 467 480 513 544 567 Breast cancer cell line (Breast cancer) 1 2 5 6 11 12 15 18 19 23 24 27 33 38 44 45 46 47 53 55 60 63 64 66 71 75 76 79 84 85 88 92 96 99 100 107 108 109 111 112 117 119 121 122 128 129 130 134 137 143 146 153 156 157 165 169 170 171 172 174 176 179 186 188 191 199 200 208 209 213 220 223 234 238 241 248 255 259 262 263 288 289 291 292 293 301 317 321 325 341 345 361 375 378 410 411 417 418 424 432 436 455 456 459 467 478 511 513 532 Breast cancer cell line (NCI60) 172 Breast cancer (NCI60) 17 54 57 98 124 125 126 158 188 197 198 244 252 285 293 392 403 451 Breast cancer or cell line (Breast cancer*) 0 6 11 12 23 24 26 44 46 47 55 63 64 66 67 75 84 88 99 100 107 112 117 122 137 139 147 154 156 166 176 180 186 192 195 205 206 207 211 220 234 240 256 279 284 285 288 297 313 324 325 334 341 342 356 357 366 389 397 400 411 427 448 453 467 480 481 511 513 544 547 567 Breast cancer or cell line (NCI60) 54 Breast tissue, cancer or cell line (Breast cancer*) 0 6 11 12 23 24 26 27 33 46 47 55 63 64 66 67 88 99 100 112 117 122 137 139 147 154 156 166 176 180 186 192 195 205 206 207 220 234 240 256 279 284 285 297 313 324 325 333 334 341 342 356 357 366 385 389 400 411 427 448 453 467 480 481 503 511 512 513 544 547 567 576 Breast tissue, cancer or cell line (NCI60) 54 57 60 83 114 124 126 197 223 244 392 451 457 Breast tissue, cancer or cell line (Various tumors) 474 Breast tissue or cancer (Breast cancer*) 1 2 6 11 12 23 24 26 27 33 44 46 47 55 63 64 66 67 75 84 88 99 100 107 112 117 122 129 137 139 147 154 156 166 171 172 176 180 192 195 205 206 207 208 211 213 220 234 256 279 284 285 297 313 324 325 334 342 345 356 357 366 385 389 427 436 448 453 467 480 512 513 544 567 Breast tissue or cancer (NCI60) 17 32 54 57 60 61 76 83 98 114 117 124 125 126 127 155 157 158 188 189 197 198 208 223 244 245 252 281 285 292 345 371 392 403 436 451 457 552 Breast tissue or cancer (Various tumors) 474 Cancer and cell line (B lymphoma*) 37 57 61 69 70 79 97 102 105 119 120 124 126 128 133 134 136 138 145 155 156 169 170 171 174 175 179 182 188 201 202 204 208 214 219 237 238 240 241 244 254 255 261 277 291 292 300 301 308 312 313 315 317 329 345 358 361 378 387 399 436 439 456 459 501 512 513 522 525 532 537 547 562 Cancer and cell line (Breast cancer*) 0 11 26 47 55 57 63 66 67 88 99 100 112 117 122 137 139 147 154 156 166 176 180 186 192 195 205 206 207 234 240 256 279 280 284 285 288 297 313 315 324 325 334 341 342 356 357 366 389 397 400 411 427 448 453 467 480 481 503 511 513 544 547 567 576 Cancer and cell line (Fibroblast EWS-FLI*) 90 94 104 125 158 181 196 242 244 283 303 315 320 372 379 438 485 Cancer and cell line (Fibroblast serum*) 229 318 432 509 Cancer and cell line (Gliomas*) 1 2 6 8 11 12 13 15 16 17 18 19 22 25 38 41 42 47 52 60 66 72 77 100 104 122 137 157 177 181 196 241 242 253 274 350 379 381 388 419 423 438 447 503 509 513 530 533 543 563 576 Cancer and cell line (HeLa cell cycle*) 9 48 95 163 196 253 Cancer and cell line (Leukemia*) 1 2 5 6 11 12 14 19 27 33 38 44 45 46 47 63 64 65 66 75 76 80 84 85 88 92 94 99 100 105 112 117 119 120 122 123 129 137 138 146 165 171 173 174 175 176 199 200 204 213 214 216 220 241 244 247 248 259 267 287 289 291 292 301 316 328 330 340 341 345 362 375 407 411 416 424 433 436 444 445 448 453 456 465 470 478 489 500 516 539 540 557 560 Cancer and cell line (Liver cancer) 1 2 3 5 6 11 12 17 18 19 23 24 27 33 38 40 41 43 44 45 46 47 54 55 57 58 60 63 64 66 72 73 75 76 78 79 83 84 85 88 90 92 93 94 96 98 99 100 105 106 107 108 109 111 112 113 114 117 119 121 122 124 125 126 128 129 130 131 132 135 137 139 140 146 151 154 156 158 162 164 165 169 170 171 172 174 176 180 184 185 190 191 197 198 199 200 205 208 209 212 213 220 221 223 224 234 235 236 239 244 247 248 249 252 259 262 263 265 286 287 289 292 294 295 297 305 306 310 315 320 321 324 327 329 337 342 343 345 349 354 357 368 372 373 375 377 385 387 392 397 401 403 404 410 415 416 417 424 426 431 433 436 438 440 451 456 458 474 478 481 485 493 495 505 530 544 545 Cancer and cell line (Lung cancer*) 1 2 5 6 7 8 11 12 19 23 24 33 36 38 40 41 44 45 46 52 53 55 58 59 60 64 66 68 72 75 76 84 88 89 92 93 94 96 100 104 107 108 109 112 113 118 121 122 123 129 130 131 137 139 148 153 154 164 165 168 172 175 176 180 181 189 190 191 194 199 200 203 204 209 213 220 222 223 234 235 242 259 262 263 272 274 280 297 298 310 311 322 324 326 327 342 357 360 372 373 379 381 382 385 390 391 401 404 410 416 418 421 426 428 431 438 455 462 464 467 471 486 503 513 514 528 533 534 540 543 552 573 575 Cancer and cell line (NCI60*) 1 2 5 6 11 12 14 15 19 24 33 38 44 45 47 51 55 60 66 79 80 84 88 99 100 112 119 122 128 129 137 139 154 170 176 178 180 200 213 220 227 279 287 297 321 331 342 357 362 390 418 426 436 444 455 491 492 493 505 513 516 568 Cancer and cell line (Neuro tumors*) 1 2 3 5 6 8 11 12 13 15 17 18 19 20 24 28 29 32 38 47 50 52 55 60 62 66 72 83 88 91 98 100 105 111 113 114 118 137 151 152 155 157 159 177 190 220 226 241 245 257 274 307 316 321 323 355 419 447 474 488 497 524 Cancer and cell line (Prostate cancer) 32 83 114 151 Cancer and cell line (Various tumors*) 2 5 6 11 12 15 16 19 23 24 29 33 38 44 45 46 50 53 55 64 66 70 75 76 84 88 94 100 103 105 112 113 117 120 123 129 137 138 141 154 162 165 174 175 176 177 197 204 213 215 218 220 241 274 289 291 292 297 322 324 357 361 368 373 375 489 500 557 Cancer and cell line (Various tumors) 2 6 12 19 60 Cancer (B lymphoma*) 21 33 37 57 61 69 70 79 97 102 105 119 120 124 126 128 133 134 136 138 145 155 156 169 170 171 172 174 175 179 182 188 198 201 202 204 208 214 219 237 238 240 241 244 252 254 255 261 277 291 292 300 301 308 312 313 315 317 329 330 345 358 361 378 387 403 436 439 451 456 459 501 512 513 522 525 532 537 547 562 Cancer (Breast cancer*) 1 2 6 11 12 23 24 26 27 33 44 46 47 55 63 64 66 67 75 84 88 99 100 107 112 117 122 129 137 139 147 154 166 171 172 176 180 192 195 205 206 207 208 209 211 220 234 256 279 284 285 297 324 325 334 342 345 356 357 366 389 418 427 436 448 453 467 480 513 544 567 Cancer (Gliomas*) 1 2 6 8 11 12 13 15 16 17 18 19 22 25 38 41 42 47 52 60 66 72 77 100 104 122 137 157 177 181 196 241 242 253 274 350 379 381 388 419 423 438 447 503 509 513 530 533 543 563 576 Cancer (Leukemia*) 1 2 5 6 11 12 14 19 27 33 38 44 45 46 47 63 64 65 66 75 76 80 84 85 88 92 94 99 100 105 112 117 119 120 122 123 129 137 138 146 165 171 173 174 175 176 199 200 204 213 214 216 220 241 244 247 248 259 267 287 289 291 292 301 316 328 330 340 341 345 362 375 407 411 416 424 433 436 444 445 448 453 456 465 470 478 489 500 516 539 540 557 560 Cancer (Liver cancer) 1 2 5 6 12 17 18 19 23 24 27 33 38 40 41 43 44 45 46 47 54 55 60 63 64 66 75 76 78 79 84 88 90 92 93 99 100 106 107 108 112 113 117 121 122 128 129 135 137 140 146 151 154 164 170 171 172 176 190 198 199 200 208 209 212 220 223 234 235 239 252 259 263 287 289 292 297 306 321 324 342 345 354 357 375 377 382 397 433 436 440 474 481 485 495 544 552 Cancer (Lung cancer*) 1 2 5 6 7 8 11 12 19 23 24 33 36 38 40 41 44 45 46 52 53 55 58 59 60 64 66 68 72 75 76 84 88 89 92 93 94 96 100 104 107 108 109 112 113 118 121 122 123 129 130 131 137 139 148 153 154 164 165 168 172 175 176 180 181 189 190 191 194 199 200 203 204 209 213 220 222 223 234 235 242 259 262 263 272 274 280 297 298 310 311 322 324 326 327 342 357 360 372 373 379 381 382 385 390 391 401 404 410 416 418 421 426 428 431 438 455 462 464 467 471 486 503 513 514 528 533 534 540 543 552 573 575 Cancer (Neuro tumors*) 1 2 3 5 6 8 11 12 13 15 17 18 19 20 24 28 29 32 38 47 50 52 55 60 62 66 72 83 88 91 98 100 105 111 113 114 118 137 151 152 155 157 159 177 190 220 226 241 245 257 274 307 316 321 323 355 419 447 474 488 497 524 Cancer (Prostate cancer) 32 83 114 151 Cancer (Various tumors*) 2 5 6 11 12 15 16 19 23 24 29 33 38 44 45 46 50 53 55 64 66 70 75 76 84 88 94 100 103 105 112 113 117 120 123 129 137 138 141 154 162 165 174 175 176 177 197 204 213 215 218 220 241 274 289 291 292 297 322 324 357 361 368 373 375 489 500 557 Cancer (Various tumors) 2 6 12 19 60 Cell line (B lymphoma) 3 5 6 8 16 17 18 27 44 45 52 53 54 57 60 61 63 72 73 76 79 84 88 96 97 98 102 105 119 124 125 126 128 143 144 145 169 170 171 182 188 197 198 208 212 219 223 238 244 252 261 265 292 293 300 301 303 308 315 345 358 361 397 403 427 436 438 447 451 485 Cell line (Breast cancer) 1 2 5 6 11 12 17 19 23 24 27 33 38 44 45 46 47 51 54 57 58 60 63 64 66 73 75 76 79 80 84 85 92 96 99 100 107 108 109 111 117 119 121 122 128 129 130 134 137 143 146 147 157 158 165 169 170 171 172 174 176 179 188 191 192 195 199 200 208 209 213 220 223 234 238 241 248 255 259 262 263 265 279 287 288 289 291 292 293 301 315 317 321 324 329 334 345 356 361 375 378 387 397 403 410 418 424 426 427 432 433 436 451 455 456 459 467 478 480 503 511 512 513 532 576 Cell line (Fibroblast EWS-FLI*) 90 94 104 125 158 181 196 242 244 283 303 315 320 372 379 438 485 Cell line (Fibroblast serum*) 229 318 432 509 Cell line (HeLa cell cycle*) 9 48 95 163 196 253 Cell line (Liver cancer) 2 3 5 6 11 12 17 18 19 23 24 27 32 33 38 40 43 44 45 46 49 52 53 54 57 58 60 63 64 66 68 72 75 76 78 79 84 85 93 96 98 100 102 105 107 108 109 111 113 117 119 121 124 125 126 128 130 131 132 135 137 139 145 158 164 165 169 170 171 172 177 180 184 188 196 197 198 199 205 208 209 212 213 219 221 223 235 238 244 247 248 249 252 253 259 263 265 283 286 292 294 298 305 310 315 318 320 327 337 343 345 361 368 373 377 385 388 392 397 401 403 404 410 415 416 417 418 424 426 436 438 440 451 456 457 467 478 485 491 495 505 533 568 575 Cell line (NCI60*) 1 2 3 5 6 11 12 14 15 19 23 24 33 38 44 45 47 55 60 66 79 84 88 99 100 112 119 122 128 129 137 139 154 170 176 178 180 200 213 220 227 248 279 287 297 321 331 342 357 362 390 418 426 436 444 455 491 492 493 505 513 516 568 Centroblasts (Various tumors) 51 80 93 107 109 125 158 172 179 199 200 209 234 255 315 317 320 378 401 403 439 451 459 552 Chronic lymphocytic leukemia (B lymphoma) 3 5 8 12 15 16 17 18 21 24 46 52 53 54 56 57 61 64 72 75 76 79 84 98 102 105 118 119 124 126 128 145 156 168 169 170 172 188 197 198 209 212 219 222 237 238 240 252 254 300 301 303 308 312 313 315 361 399 403 436 438 439 451 456 485 513 522 537 547 562 573 Classical malignant glioblastoma (Gliomas) 15 16 52 118 CNS cancer or cell line (Gliomas*) 1 2 6 8 11 12 13 15 16 17 18 19 22 25 38 41 42 47 52 60 66 72 77 100 104 122 137 157 177 181 196 241 242 253 274 350 379 381 388 419 423 438 447 503 509 513 530 533 543 563 576 CNS cancer or cell line (Neuro tumors*) 1 2 3 5 6 8 11 12 15 17 18 19 20 24 28 29 32 38 47 50 52 55 60 62 66 72 83 88 91 98 100 105 111 113 114 118 137 151 152 155 157 159 177 190 197 226 241 245 257 274 291 299 307 321 323 355 363 419 447 474 488 497 524 CNS cancer or cell line (Various tumors) 11 23 29 66 83 93 96 100 103 114 137 139 151 154 171 172 180 188 208 209 238 292 301 322 324 342 361 410 418 436 455 488 497 500 543 CNS tissue, cancer or cell line (Gliomas*) 1 2 6 8 11 12 13 15 16 17 18 19 22 25 38 41 42 47 52 60 66 72 77 100 104 122 137 157 177 181 196 241 242 253 274 350 379 381 388 419 423 438 447 503 509 513 530 533 543 563 576 CNS tissue, cancer or cell line (Neuro tumors*) 1 2 3 5 6 8 11 12 13 15 17 18 19 20 24 28 29 32 38 47 50 52 55 60 62 66 72 83 88 91 98 100 105 111 114 118 137 151 152 155 157 159 174 177 190 197 198 226 241 245 257 274 291 299 307 321 323 355 363 419 447 474 488 497 513 524 CNS tissue, cancer or cell line (Various tumors) 5 6 11 12 23 24 29 38 44 66 83 96 100 103 114 137 139 151 154 171 172 180 188 208 209 238 274 292 297 322 324 342 345 357 361 390 410 436 455 488 497 500 543 CNS tumor (Gliomas*) 1 2 6 8 11 12 13 15 16 17 18 19 22 25 38 41 42 47 52 60 66 72 77 100 104 122 137 157 177 181 196 241 242 253 274 350 379 381 388 419 423 438 447 503 509 513 530 533 543 563 576 CNS tumor (Neuro tumors*) 1 2 3 5 6 8 11 12 15 17 18 19 20 24 28 29 32 38 47 50 52 55 60 62 66 72 83 88 91 98 100 105 111 113 114 118 137 151 152 155 157 159 177 190 197 226 241 245 257 274 291 299 307 321 323 355 363 419 447 474 488 497 524 CNS tumor (Various tumors) 11 23 29 66 83 93 96 100 103 114 137 139 151 154 171 172 180 188 208 209 238 292 301 322 324 342 361 410 418 436 455 488 497 500 543 Colon cancer cell line (NCI60) 3 79 122 128 Colon cancer (Liver cancer) 58 78 130 131 184 194 221 224 236 286 305 310 343 373 385 401 417 464 493 505 Colon cancer metastasis to liver (Liver cancer) 58 78 130 131 184 194 221 224 236 286 305 310 343 373 385 401 417 464 493 505 Colon cancer or cell line (Liver cancer) 58 78 130 131 184 194 221 224 236 286 305 310 343 373 385 401 417 464 493 505 Colon cancer or cell line (NCI60) 3 79 122 128 Colon tissue, cancer or cell line (Liver cancer) 58 78 130 131 184 194 221 224 236 286 305 310 343 373 385 401 417 464 493 505 Colon tissue, cancer or cell line (NCI60) 3 79 122 128 Dead prognosis (Breast cancer) 52 Diffuse large B cell lymphoma - DLBCL (B lymphoma) 2 5 6 11 12 23 24 27 33 38 41 45 46 47 52 53 55 60 64 70 75 76 79 84 88 92 94 107 108 112 113 117 118 120 122 128 134 137 138 145 164 169 170 172 174 175 176 188 201 209 210 211 213 220 237 238 241 263 291 301 324 329 358 361 371 387 399 497 512 513 562 Diffuse large B cell lymphoma - DLBCL (Various tumors) 19 119 143 154 164 194 208 292 300 342 345 436 464 557 Diffuse large B cell lymphoma tumor or cell line (B lymphoma) 2 5 6 11 12 16 23 24 33 38 41 45 46 47 52 53 54 55 60 64 66 70 75 76 79 84 88 94 100 105 107 108 112 113 117 118 122 128 134 137 138 145 169 170 172 174 176 188 201 209 210 211 212 213 220 237 238 241 263 291 301 324 329 361 371 387 399 451 512 513 562 Diffuse large B cell lymphoma tumor or cell line (Various tumors) 19 119 143 154 164 194 208 292 300 342 345 436 464 557 E. coli stimulated immune cells (Stimulated PBMC) 532 Epithelial cell line (Breast cancer) 143 147 192 195 200 256 279 334 356 427 480 503 576 Epithelial cell line (HeLa cell cycle*) 9 48 95 163 196 253 Epithelial cell line (NCI60) 1 2 5 6 11 12 15 16 19 33 38 44 45 47 52 53 55 60 66 84 88 100 105 118 137 138 174 176 213 234 241 488 Estogen receptor (ER) positive breast cancer (Breast cancer) 357 EWS/FLI expressing fibroblasts (Fibroblast EWS-FLI*) 90 94 104 125 158 181 196 242 244 283 303 315 320 372 379 438 485 Fast doubling (20-40) cell lines (NCI60) 23 27 38 79 88 122 128 129 170 292 321 Female hormonal cancer (Breast cancer*) 1 2 6 11 12 23 24 26 27 33 44 46 47 55 63 64 66 67 75 84 88 99 100 107 112 117 122 129 137 139 147 154 166 171 172 176 180 192 195 205 206 207 208 209 211 220 234 256 279 284 285 297 324 325 334 342 345 356 357 366 389 418 427 436 448 453 467 480 513 544 567 Female hormonal cancer cell line (Breast cancer) 0 1 2 5 6 11 12 15 16 19 23 24 27 33 38 44 45 46 47 53 60 63 64 66 71 75 76 79 84 85 92 96 107 108 109 111 119 121 122 128 129 134 143 146 153 156 157 165 169 170 171 172 174 179 186 188 191 199 200 208 209 213 223 238 241 255 259 262 263 288 289 291 292 293 301 317 321 325 341 345 361 375 378 410 411 417 418 424 436 454 455 456 459 467 478 511 513 Female hormonal cancer or cell line (Breast cancer*) 0 6 11 12 23 24 26 44 46 47 55 63 64 66 67 75 84 88 99 100 107 112 117 122 137 139 147 154 156 166 176 180 186 192 195 205 206 207 211 220 234 240 256 279 284 285 297 313 324 325 334 341 342 356 357 366 389 411 427 448 453 467 480 481 511 513 544 547 567 Female hormonal tissue, cancer or cell line (Breast cancer*) 0 6 11 12 23 24 26 27 33 46 47 55 63 64 66 67 75 88 99 100 112 117 122 129 137 139 147 154 156 166 176 180 186 192 195 205 206 207 220 234 240 256 279 284 285 297 313 324 325 333 334 341 342 356 357 366 385 389 411 427 448 453 467 480 481 503 511 512 513 547 567 576 Female hormonal tissue, cancer or cell line (NCI60) 54 Female hormonal tissue, cancer or cell line (Various tumors) 47 190 Female hormonal tissue or cancer (Breast cancer*) 1 2 6 11 12 23 24 26 27 33 44 46 47 55 63 64 66 67 75 84 88 99 100 107 112 117 122 129 137 139 147 154 156 166 171 172 176 180 192 195 205 206 207 208 211 213 220 234 256 279 284 285 297 313 324 325 334 342 345 356 357 366 385 389 427 436 448 453 467 480 512 513 544 567 Female hormonal tissue or cancer (NCI60) 17 32 54 57 60 61 76 83 98 114 117 124 125 126 127 155 157 158 188 189 197 198 208 223 244 245 252 281 285 292 345 371 392 403 436 451 457 552 Female hormonal tissue or cancer (Various tumors) 47 190 Fibroadenoma (Breast cancer) 177 Fibroblasts (Fibroblast EWS-FLI*) 90 94 104 125 158 181 196 242 244 283 303 315 320 372 379 438 485 Fibroblasts (Fibroblast infection*) 55 458 537 Fibroblasts (Fibroblast serum*) 229 318 432 Focal nodular hyperplasia (FNH) of the liver (Liver cancer) 201 Follicular lymphoma (B lymphoma) 3 18 33 52 53 62 70 103 118 120 133 134 138 152 158 160 174 175 214 219 241 291 307 320 329 387 Follicular lymphoma (Various tumors) 3 8 18 40 62 72 152 GC B like DLBCL (B lymphoma) 79 84 103 107 117 118 128 145 169 170 188 209 210 238 301 456 513 562 GC B like DLBCL (Various tumors) 51 80 93 107 109 125 158 172 179 199 200 209 234 255 315 317 320 378 401 403 439 451 459 552 Grade 1 (Breast cancer) 53 254 Grade 3 (Breast cancer) 3 8 16 17 18 53 54 57 98 124 125 126 158 197 198 252 315 451 Gram negative bacteria stimulated immune cells (Stimulated PBMC) 3 15 16 38 44 45 46 53 54 57 61 64 72 75 79 84 108 118 119 124 126 128 143 170 171 197 208 212 244 252 254 292 293 308 312 315 345 397 403 436 439 451 485 HeLa cell line (HeLa cell cycle*) 9 48 95 163 196 253 Hematologic cancer and cell line (B lymphoma*) 37 57 61 69 70 79 97 102 105 119 120 124 126 128 133 134 136 138 145 155 156 169 170 171 174 175 179 182 188 201 202 204 208 214 219 237 238 240 241 244 254 255 261 277 291 292 300 301 308 312 313 315 317 329 345 358 361 378 387 399 436 439 456 459 501 512 513 522 525 532 537 547 562 Hematologic cancer and cell line (Leukemia*) 1 2 5 6 11 12 14 19 27 33 38 44 45 46 47 63 64 65 66 75 76 80 84 85 88 92 94 99 100 105 112 117 119 120 122 123 129 137 138 146 165 171 173 174 175 176 199 200 204 213 214 216 220 241 244 247 248 259 267 287 289 291 292 301 316 328 330 340 341 345 362 375 407 411 416 424 433 436 444 445 448 453 456 465 470 478 489 500 516 539 540 557 560 Hematologic cancer and cell line (NCI60) 3 15 18 52 122 126 129 177 259 321 419 484 539 543 Hematologic cancer and cell line (Stimulated immune*) 3 4 5 8 9 15 16 17 18 22 27 28 32 35 39 42 43 44 45 46 48 50 52 53 62 64 73 75 76 77 82 83 84 86 87 91 95 98 108 114 116 118 123 124 126 128 150 151 152 159 163 165 177 183 196 197 198 211 212 219 226 233 239 243 252 253 257 263 264 265 273 275 277 278 281 307 321 323 332 346 352 363 371 395 399 408 412 414 488 491 492 509 522 537 568 Hematologic cancer and cell line (Stimulated PBMC) 3 5 6 8 15 16 17 18 19 21 27 31 36 38 44 45 46 52 53 54 55 56 57 60 61 64 72 73 75 79 84 88 92 98 102 105 108 114 117 118 119 121 124 125 126 128 134 143 144 145 146 151 152 158 164 169 170 171 174 188 192 197 198 208 212 219 223 237 238 241 244 248 252 254 263 265 278 289 291 292 293 300 301 303 308 312 315 320 321 337 345 349 361 367 375 397 399 403 426 433 436 438 439 450 451 456 485 488 522 537 538 543 Hematologic cancer and cell line (Various tumors) 1 2 3 5 6 12 15 19 23 24 29 38 47 52 60 72 119 122 129 143 154 164 177 292 293 297 321 324 342 345 357 373 385 387 430 436 474 557 Hematologic cancer (B lymphoma*) 21 33 37 57 61 69 70 79 97 102 105 119 120 124 126 128 133 134 136 138 145 155 156 169 170 171 172 174 175 179 182 188 198 201 202 204 208 214 219 237 238 240 241 244 252 254 255 261 277 291 292 300 301 308 312 313 315 317 329 330 345 358 361 378 387 403 436 439 451 456 459 501 512 513 522 525 532 537 547 562 Hematologic cancer (Leukemia*) 1 2 5 6 11 12 14 19 27 33 38 44 45 46 47 63 64 65 66 75 76 80 84 85 88 92 94 99 100 105 112 117 119 120 122 123 129 137 138 146 165 171 173 174 175 176 199 200 204 213 214 216 220 241 244 247 248 259 267 287 289 291 292 301 316 328 330 340 341 345 362 375 407 411 416 424 433 436 444 445 448 453 456 465 470 478 489 500 516 539 540 557 560 Hematologic cancer (Various tumors) 1 2 3 5 6 12 15 19 23 24 29 38 47 52 60 72 119 122 129 143 154 164 177 292 293 297 321 324 342 345 357 373 385 387 430 436 474 557 Hematologic samples and cell lines (B lymphoma) 6 11 13 19 23 27 33 38 41 45 47 52 55 56 60 64 66 70 75 88 94 99 100 105 112 113 117 118 120 122 123 129 133 134 137 138 146 154 165 174 175 176 183 201 202 204 213 214 220 241 274 288 289 291 297 316 324 329 330 342 357 375 387 453 486 489 497 500 512 Hematologic samples and cell lines (Leukemia*) 1 2 5 6 11 12 14 19 27 33 38 44 45 46 47 63 64 65 66 75 76 80 84 85 88 92 94 99 100 105 112 117 119 120 122 123 129 137 138 146 165 171 173 174 175 176 199 200 204 213 214 216 220 241 244 247 248 259 267 287 289 291 292 301 316 328 330 340 341 345 362 375 407 411 416 424 433 436 444 445 448 453 456 465 470 478 489 500 516 539 540 557 560 Hematologic samples and cell lines (NCI60) 3 15 18 52 122 126 129 177 259 321 419 484 539 543 Hematologic samples and cell lines (Stimulated immune*) 3 4 5 8 9 15 16 17 18 22 27 28 32 35 39 42 43 44 45 46 48 50 52 53 62 64 73 75 76 77 82 83 84 86 87 91 95 98 108 114 116 118 123 124 126 128 150 151 152 159 163 165 177 183 196 197 198 211 212 219 226 233 239 243 252 253 257 263 264 265 273 275 277 278 281 307 321 323 332 346 352 363 371 395 399 408 412 414 488 491 492 509 522 537 568 Hematologic samples and cell lines (Stimulated PBMC*) 5 15 21 31 37 46 56 61 64 69 73 75 76 79 84 92 97 102 108 119 121 124 126 128 136 143 145 169 170 171 174 179 182 188 208 210 219 223 237 238 241 244 254 255 261 263 291 292 293 300 301 303 308 312 315 317 345 358 367 371 375 376 378 399 433 436 439 456 459 481 488 521 522 525 532 537 544 562 Hematologic samples and cell lines (Various tumors) 1 2 3 5 6 12 19 23 24 38 47 52 53 54 57 60 72 85 92 93 112 122 125 129 143 154 158 164 177 179 183 194 199 200 220 252 255 259 292 293 297 317 321 324 342 345 357 373 378 385 387 403 426 430 436 439 451 459 464 474 484 552 557 Hematologic samples (B lymphoma) 16 18 37 53 54 69 79 93 126 128 136 164 169 170 179 204 212 222 255 261 315 317 378 397 430 484 532 Hematologic samples (Stimulated PBMC*) 5 27 37 44 45 46 64 69 75 76 79 84 92 97 108 119 121 126 128 136 169 170 171 174 179 182 208 210 223 241 254 255 261 263 291 292 300 303 312 317 345 358 371 375 378 399 433 436 456 459 481 488 521 522 525 532 537 544 562 Hematologic samples (Various tumors) 1 2 3 5 6 12 19 23 24 38 47 52 53 54 57 60 72 85 92 93 112 122 125 129 143 154 158 164 177 179 183 194 199 200 220 252 255 259 292 293 297 317 321 324 342 345 357 373 378 385 387 403 426 430 436 439 451 459 464 474 484 552 557 Hepatitis C virus (HCV) infected liver (Liver cancer) 49 220 Hepatitis infected liver (Liver cancer*) 1 2 5 6 8 9 11 12 15 16 17 19 23 24 27 33 38 40 41 43 44 45 46 47 48 49 52 53 54 55 57 58 60 63 64 66 67 73 75 76 78 79 84 85 88 92 93 94 95 96 98 99 100 101 104 106 107 108 109 112 113 117 118 121 122 125 128 129 130 131 132 134 135 137 139 140 143 146 154 158 162 163 164 165 170 171 172 176 180 184 185 190 191 198 199 200 205 207 208 209 212 213 220 221 223 224 227 231 234 235 236 239 247 248 249 251 252 257 259 262 263 265 286 287 288 289 292 293 294 295 297 305 310 315 316 318 320 324 327 337 342 343 345 349 354 357 367 368 372 373 375 377 385 389 391 397 401 403 404 410 415 416 417 424 426 431 432 436 440 445 458 471 474 478 481 485 486 495 496 501 505 514 521 530 544 545 575 Hepatocellular carcinoma (Liver cancer) 1 2 5 6 12 17 18 23 24 27 38 41 44 45 46 47 54 55 60 63 64 66 75 76 79 84 88 90 92 99 100 108 112 117 121 122 129 137 146 154 171 176 190 203 208 212 220 234 235 239 263 289 292 297 324 342 357 375 382 397 431 432 474 485 562 Human mammary epithelial cells - HMECs (Breast cancer) 147 192 195 218 256 279 333 334 356 427 480 503 576 Human mammary epithelial cells (HMECs) or normal breast tissue (Breast cancer) 147 166 192 195 256 279 333 334 356 427 480 503 576 Human mammary epithelial cells (HMECs) or normal breast tissue (Various tumors) 1 154 297 357 474 Invasive liver tumor (Liver cancer) 3 8 17 18 23 24 27 40 46 47 52 54 55 57 63 64 72 75 88 92 93 98 99 109 112 113 117 124 125 126 129 135 146 158 176 197 198 209 212 234 235 252 289 330 337 354 375 397 403 485 495 Ionomycin PMA stimulated immune cells (Stimulated PBMC) 33 97 182 191 261 262 358 430 484 525 540 Large cell lung cancer (Lung cancer) 16 18 52 101 118 131 132 200 312 321 439 501 Leukemia (B lymphoma) 3 5 8 12 15 16 17 18 21 24 46 52 53 54 56 57 61 64 72 75 76 79 84 98 102 105 118 119 124 126 128 145 156 168 169 170 172 188 197 198 209 212 219 222 237 238 240 252 254 300 301 303 308 312 313 315 361 399 403 436 438 439 451 456 485 513 522 537 547 562 573 Leukemia cell line (NCI60) 3 15 18 52 122 126 129 177 259 321 419 484 539 543 Leukemia (Leukemia*) 1 2 5 6 11 12 14 19 27 33 38 44 45 46 47 63 64 65 66 75 76 80 84 85 88 92 94 99 100 105 112 117 119 120 122 123 129 137 138 146 165 171 173 174 175 176 199 200 204 213 214 216 220 241 244 247 248 259 267 287 289 291 292 301 316 328 330 340 341 345 362 375 407 411 416 424 433 436 444 445 448 453 456 465 470 478 489 500 516 539 540 557 560 Leukemia or leukemia cell line (B lymphoma) 3 5 8 12 15 16 17 18 21 24 46 52 53 54 56 57 61 64 72 75 76 79 84 98 102 105 118 119 124 126 128 145 156 168 169 170 172 188 197 198 209 212 219 222 237 238 240 252 254 300 301 303 308 312 313 315 361 399 403 436 438 439 451 456 485 513 522 537 547 562 573 Leukemia or leukemia cell line (Leukemia*) 1 2 5 6 11 12 14 19 27 33 38 44 45 46 47 63 64 65 66 75 76 80 84 85 88 92 94 99 100 105 112 117 119 120 122 123 129 137 138 146 165 171 173 174 175 176 199 200 204 213 214 216 220 241 244 247 248 259 267 287 289 291 292 301 316 328 330 340 341 345 362 375 407 411 416 424 433 436 444 445 448 453 456 465 470 478 489 500 516 539 540 557 560 Lipopolysaccharide (LPS) stimulated immune cells (Stimulated PBMC) 171 208 292 Live bacteria stimulated immune cells (Stimulated PBMC) 54 61 76 92 97 108 165 182 261 263 265 288 308 358 367 525 547 Liver cancer cell line (Liver cancer) 1 2 3 5 6 9 11 12 17 18 19 23 24 27 32 33 38 40 43 44 45 46 49 53 54 55 57 58 60 63 64 66 68 72 73 75 76 78 79 84 85 88 93 96 98 100 102 107 108 109 111 112 113 117 119 121 124 125 126 128 129 130 131 132 135 137 139 145 158 164 165 169 170 171 172 176 177 180 183 184 185 188 196 197 198 199 205 208 209 212 213 219 221 223 235 238 244 247 248 249 252 253 259 263 265 283 286 292 294 298 301 305 310 315 318 320 324 327 337 342 343 345 361 368 373 377 385 388 392 397 401 403 404 410 415 416 417 418 424 426 436 438 440 451 456 457 467 478 485 491 495 496 505 533 568 575 Liver tissue, cancer or cell line (Liver cancer*) 1 2 3 5 6 8 9 11 12 15 16 17 18 19 23 24 26 27 33 38 40 41 43 44 45 46 47 48 49 52 53 54 55 57 58 60 63 64 66 67 72 73 75 76 78 79 84 85 88 92 93 94 95 96 98 99 100 101 104 106 107 108 109 112 113 117 118 121 122 123 125 128 129 130 131 132 134 135 137 139 140 143 146 154 158 162 163 164 165 170 171 172 176 180 184 185 190 191 198 199 200 205 207 208 209 212 213 218 220 221 223 224 227 231 234 235 236 239 247 248 249 251 252 253 257 259 262 263 265 283 286 287 288 289 292 294 295 297 305 310 315 316 318 320 321 324 327 333 337 342 343 345 349 354 357 367 368 372 373 375 377 385 391 392 396 397 401 402 403 404 410 415 416 417 424 426 431 432 436 439 440 445 454 457 458 471 474 478 481 485 486 495 496 501 505 514 521 530 544 545 575 Liver tissue (Liver cancer*) 1 2 3 5 6 8 9 11 12 15 16 17 19 23 24 26 27 33 38 40 41 43 44 45 46 47 48 49 52 53 54 55 57 58 60 63 64 66 67 73 75 76 78 79 84 85 88 92 93 94 95 96 98 99 100 101 104 106 107 108 109 111 112 113 117 118 121 122 123 125 128 129 130 131 132 134 135 137 139 140 143 146 154 158 162 163 164 165 170 171 172 176 180 184 185 190 191 196 198 199 200 205 207 208 209 212 213 218 220 221 223 224 227 231 234 235 236 239 247 248 249 251 252 253 257 259 262 263 265 286 287 288 289 292 293 294 295 297 305 310 315 316 318 320 321 324 327 333 337 342 343 345 349 354 357 367 368 372 373 375 377 385 391 396 397 401 403 404 410 415 416 417 424 426 431 432 436 439 440 445 451 454 458 471 474 478 481 485 486 495 496 501 505 514 521 530 544 545 575 Lung cancer (Lung cancer*) 1 2 5 6 7 8 11 12 19 23 24 33 36 38 40 41 44 45 46 52 53 55 58 59 60 64 66 68 72 75 76 84 88 89 92 93 94 96 100 104 107 108 109 112 113 118 121 122 129 130 131 137 139 148 153 154 164 165 168 172 176 180 181 190 191 194 199 200 203 204 209 213 220 222 223 234 235 242 259 262 263 272 274 280 297 298 310 311 322 324 326 327 342 357 360 372 373 379 381 382 385 390 391 401 404 410 416 418 421 426 428 431 438 455 462 464 467 471 486 513 514 528 533 534 540 543 552 573 575 Lung cancer or cell line (Lung cancer*) 1 2 5 6 7 8 11 12 19 23 24 33 36 38 40 41 44 45 46 52 53 55 58 59 60 64 66 68 72 75 76 84 88 89 92 93 94 96 100 104 107 108 109 112 113 118 121 122 129 130 131 137 139 148 153 154 164 165 168 172 176 180 181 190 191 194 199 200 203 204 209 213 220 222 223 234 235 242 259 262 263 272 274 280 297 298 310 311 322 324 326 327 342 357 360 372 373 379 381 382 385 390 391 401 404 410 416 418 421 426 428 431 438 455 462 464 467 471 486 513 514 528 533 534 540 543 552 573 575 Lung carcinoid (Lung cancer) 3 5 7 11 15 17 18 22 25 27 36 41 42 43 44 47 58 62 63 66 67 68 77 79 84 100 103 104 107 109 113 116 119 126 128 130 131 137 143 144 148 152 164 169 170 171 174 177 181 184 208 209 215 221 223 241 242 254 259 272 273 274 275 291 292 293 298 307 311 312 321 326 327 345 361 363 379 381 390 391 399 401 412 416 418 431 436 455 462 486 488 513 524 543 563 573 Lung tissue, cancer or cell line (Lung cancer*) 1 2 5 6 7 8 11 12 17 19 21 23 24 31 33 36 38 40 41 44 45 46 52 53 54 55 56 58 59 60 64 66 68 72 75 76 84 88 89 90 92 93 94 100 104 107 108 109 112 113 118 121 122 123 127 129 130 131 137 139 148 153 154 164 165 168 172 176 180 181 189 190 191 194 199 200 203 204 209 213 220 222 223 234 235 242 259 262 263 272 274 278 280 297 298 310 311 322 324 326 327 342 357 360 372 373 379 381 382 385 390 391 401 404 416 418 421 426 428 431 438 455 462 464 467 471 486 513 514 528 533 534 538 540 543 552 573 575 Lymphocytes (B lymphoma*) 21 37 57 61 69 70 79 97 102 105 119 120 124 126 128 133 134 136 145 156 169 170 171 174 175 179 182 188 198 201 202 204 208 210 214 219 237 238 240 241 244 252 254 255 261 277 291 292 300 301 303 308 312 313 315 317 329 345 358 361 378 387 399 403 436 439 451 456 459 501 512 513 522 525 532 537 547 562 Lymphocytes (Leukemia) 2 5 6 12 16 19 23 24 33 38 45 47 55 60 64 75 76 79 84 88 96 104 107 108 109 112 113 122 128 146 154 165 170 172 174 175 176 181 198 200 209 216 220 234 241 247 263 267 287 289 291 297 316 324 328 330 342 357 375 410 426 433 Lymphocytes (Stimulated PBMC*) 5 27 37 44 45 46 64 69 75 76 79 84 92 97 108 119 121 126 128 136 169 170 171 174 179 182 208 210 223 241 254 255 261 263 291 292 300 303 312 317 345 358 371 375 378 399 433 436 456 459 481 488 521 522 525 532 537 544 562 Lymphocytes (Various tumors) 1 2 3 6 12 19 23 24 38 47 52 60 72 119 122 143 154 164 177 292 293 297 321 324 342 345 357 373 385 436 474 557 Lymphoma (B lymphoma) 6 11 13 19 27 33 41 52 55 60 64 66 70 88 94 99 100 104 105 110 112 113 117 120 122 123 129 133 134 137 138 146 154 160 165 173 174 175 176 183 200 201 202 213 214 220 233 241 274 278 289 291 297 307 316 321 324 329 330 342 357 363 375 387 453 486 489 497 500 501 512 Lymphoma or lymphoma cell line (B lymphoma) 3 5 6 8 11 16 18 23 33 38 41 47 52 53 54 55 60 66 70 72 76 79 84 88 94 98 100 105 107 112 117 118 120 128 134 137 138 145 154 169 170 172 175 176 188 198 201 202 209 212 213 214 220 238 244 252 274 289 297 301 329 361 387 512 513 562 Lymphoma (Various tumors) 1 2 6 12 19 23 38 47 52 72 119 143 164 206 292 293 324 342 345 436 524 557 Macrophages (Stimulated immune*) 3 4 5 8 9 15 16 17 18 22 27 28 32 35 39 42 43 44 45 46 48 50 52 53 62 64 73 75 76 77 82 83 84 86 87 91 95 98 108 114 116 118 123 124 126 128 150 151 152 159 163 165 177 183 196 197 198 211 212 219 226 233 239 243 252 253 257 263 264 265 273 275 277 278 281 307 321 323 332 346 352 363 371 395 399 408 412 414 488 491 492 509 522 537 568 Macrophages (Stimulated PBMC) 3 5 6 8 15 16 17 18 19 21 27 31 36 38 44 45 46 52 53 54 55 56 57 60 61 64 72 73 75 79 84 88 92 98 102 105 108 114 117 118 119 121 124 125 126 128 134 143 144 145 146 151 152 158 164 169 170 171 174 188 192 197 198 208 212 219 223 237 238 241 244 248 252 254 263 265 278 289 291 292 293 300 301 303 308 312 315 320 321 337 345 349 361 367 375 397 399 403 426 433 436 438 439 450 451 456 485 488 522 537 538 543 Malignant glioblastoma (Neuro tumors) 12 44 84 Malignant glioblastoma (Various tumors) 11 29 83 96 103 114 151 171 172 180 209 342 410 455 543 Medulloblastoma (Neuro tumors) 5 19 44 60 324 Medulloblastoma (Various tumors) 188 301 497 Melanoma cell line (NCI60) 18 139 180 335 346 408 433 491 492 568 Melanoma tumor or cell line (NCI60) 18 139 180 335 346 408 433 491 492 568 Memory B cells (B lymphoma) 513 Mesenchemal cell line (Breast cancer) 8 68 96 105 197 213 278 298 312 321 361 418 455 Metastasis (Liver cancer) 8 19 23 24 40 43 55 58 60 75 78 88 93 107 109 112 117 130 131 132 135 140 152 164 171 172 176 184 194 205 209 212 221 224 227 235 236 247 249 265 272 286 294 295 305 306 321 327 343 373 377 385 401 404 415 417 432 436 440 464 493 495 496 505 519 530 Monocytes (Leukemia*) 1 2 5 6 11 12 14 19 27 33 38 44 45 46 47 63 64 65 66 75 76 80 84 85 88 92 94 99 100 105 112 117 119 120 122 123 129 137 138 146 165 171 173 174 175 176 199 200 204 213 214 216 220 241 244 247 248 259 267 287 289 291 292 301 316 328 330 340 341 345 362 375 407 411 416 424 433 436 444 445 448 453 456 465 470 478 489 500 516 539 540 557 560 Monocytes (Stimulated immune*) 3 4 5 8 9 15 16 17 18 22 27 28 32 35 39 42 43 44 45 46 48 50 52 53 62 64 73 75 76 77 82 83 84 86 87 91 95 98 108 114 116 118 123 124 126 128 150 151 152 159 163 165 177 183 196 197 198 211 212 219 226 233 239 243 252 253 257 263 264 265 273 275 277 278 281 307 321 323 332 346 352 363 371 395 399 408 412 414 488 491 492 509 522 537 568 Monocytes (Stimulated PBMC*) 5 15 21 31 37 46 56 61 64 69 73 75 76 79 84 92 97 102 108 119 121 124 126 128 136 143 145 169 170 171 174 179 182 188 208 210 219 223 237 238 241 244 254 255 261 263 291 292 293 300 301 303 308 312 315 317 345 358 367 371 375 376 378 399 433 436 439 456 459 481 488 521 522 525 532 537 544 562 Monocytes (Various tumors) 1 2 3 6 12 19 23 24 38 47 52 60 72 119 122 143 154 164 177 292 293 297 321 324 342 345 357 373 385 436 474 557 Mutated p53 tumor (Breast cancer) 52 53 118 Node in lung (Lung cancer) 26 49 371 400 562 Non-classic anaplastic oligodendroglioma (Gliomas) 15 72 Non-classic malignant glioblastoma (Gliomas) 15 16 19 52 60 118 Non small cell lung cancer and cell line (Lung cancer*) 1 2 5 6 7 11 12 19 23 24 33 36 38 41 44 45 46 52 53 55 58 60 64 66 68 72 75 76 84 88 89 92 93 94 100 104 107 108 112 113 118 121 122 129 130 131 137 139 148 153 154 164 165 168 172 176 180 181 190 194 203 204 209 213 220 222 223 234 235 242 262 263 274 280 297 298 310 311 322 324 326 342 357 360 372 373 379 381 382 385 391 401 404 418 421 426 428 431 438 462 464 467 471 486 514 528 533 534 540 543 552 573 575 Non small cell lung cancer (Lung cancer*) 1 2 5 6 7 11 12 19 23 24 33 36 38 41 44 45 46 52 53 55 58 60 64 66 68 72 75 76 84 88 89 92 93 94 100 104 107 108 112 113 118 121 122 129 130 131 137 139 148 153 154 164 165 168 172 176 180 181 190 194 203 204 209 213 220 222 223 234 235 242 262 263 274 280 297 298 310 311 322 324 326 342 357 360 372 373 379 381 382 385 391 401 404 418 421 426 428 431 438 462 464 467 471 486 514 528 533 534 540 543 552 573 575 Non-tumor liver tissue (Liver cancer) 1 2 5 6 11 12 17 18 19 23 24 26 27 33 38 40 41 43 44 45 46 47 54 55 57 58 60 63 64 66 72 73 75 76 78 79 84 85 88 92 93 94 96 98 99 100 106 107 108 109 111 112 113 117 121 123 124 125 126 128 129 130 131 132 134 135 137 140 146 154 157 158 164 170 171 172 176 184 190 191 196 197 198 199 200 205 208 209 212 213 221 223 224 227 234 235 236 244 247 248 249 252 253 259 262 263 265 288 289 292 294 295 297 305 310 315 320 324 337 342 343 345 354 372 373 375 377 378 397 401 403 404 407 410 415 417 424 426 436 439 440 451 458 459 474 481 485 495 496 501 505 521 532 544 545 Normal breast tissue (Various tumors) 1 154 297 357 474 Normal cerebellum tissue (Neuro tumors) 11 66 100 137 274 307 Normal cerebellum tissue (Various tumors) 11 66 100 137 274 Normal CNS tissue (Neuro tumors) 11 66 100 137 274 307 Normal CNS tissue (Various tumors) 11 66 100 137 274 Normal female hormonal tissue and cells (Breast cancer) 147 166 192 195 256 279 333 334 356 427 480 503 576 Normal female hormonal tissue and cells (Various tumors) 1 2 19 47 80 170 190 200 259 474 Normal female hormonal tissue (Various tumors) 1 2 19 47 80 170 190 200 259 474 Normal lung tissue (Lung cancer) 1 3 5 7 8 16 17 18 21 31 53 54 56 57 61 72 89 90 96 98 102 105 124 125 126 127 128 148 158 168 170 189 197 198 203 211 219 222 235 244 252 265 278 283 315 320 322 326 337 376 392 397 401 403 410 421 428 450 451 462 471 485 528 538 543 552 557 571 Normal lung tissue (Various tumors) 147 Normal lymphocytes (B lymphoma) 69 79 128 170 182 261 397 430 513 525 Normal prostate tissue (Prostate cancer) 47 139 419 519 524 Normal prostate tissue (Various tumors) 54 202 497 Normal tissue (Liver cancer) 1 26 27 40 43 45 46 54 55 57 58 64 75 78 88 92 93 94 107 108 109 112 113 117 121 123 129 130 131 135 164 172 176 184 209 212 221 235 252 262 294 305 320 343 397 417 439 474 481 495 544 545 Normal tissue (Lung cancer) 1 3 5 7 8 16 17 18 21 31 53 54 56 57 72 89 90 96 98 102 105 124 125 126 127 128 148 158 168 170 189 197 198 203 211 219 222 235 244 252 265 278 320 322 326 337 376 392 397 401 403 410 421 428 450 451 471 485 528 538 543 552 557 571 Normal tissue (Neuro tumors) 11 66 100 137 274 307 Normal tissue (Prostate cancer) 47 139 419 519 524 Normal tissue (Various tumors) 1 2 19 54 215 343 373 387 451 497 p53 positive hepatocellular carcinoma (Liver cancer) 3 17 53 54 57 72 98 125 165 197 252 485 Primary blood mononuclear cells (B lymphoma) 72 79 96 97 119 128 170 182 223 277 292 436 478 Primary blood mononuclear cells (Leukemia) 38 47 55 63 85 88 92 99 107 109 113 122 199 200 220 247 248 259 265 267 287 316 328 340 424 433 439 448 Primary blood mononuclear cells (Stimulated PBMC*) 5 27 37 44 45 46 64 69 75 76 79 84 92 97 108 119 121 126 128 136 169 170 171 174 179 182 208 210 223 241 254 255 261 263 291 292 300 303 312 317 345 358 371 375 378 399 433 436 456 459 481 488 521 522 525 532 537 544 562 Primary blood mononuclear cells (Various tumors) 1 2 3 5 6 12 15 19 23 24 29 38 47 52 60 72 119 122 129 143 154 164 177 292 293 297 321 324 342 345 357 373 385 387 430 436 474 557 Prostate cancer or cell line (Prostate cancer) 32 83 114 151 Prostate cancer (Prostate cancer) 32 83 114 151 Prostate (Prostate cancer*) 1 5 6 7 11 12 13 15 16 17 18 19 20 22 23 24 25 28 29 32 38 41 42 43 44 45 50 52 53 55 60 62 66 68 72 77 81 83 84 88 89 90 91 93 96 100 103 104 106 111 113 114 115 116 118 135 137 144 146 149 150 151 152 157 159 181 183 185 202 203 220 223 239 242 273 274 298 299 306 307 322 323 342 350 355 363 379 410 419 421 429 447 519 521 524 530 534 Prostate (Various tumors) 54 86 93 95 99 163 184 197 211 497 Renal cancer cell line (NCI60) 362 Renal cancer or cell line (NCI60) 362 Renal cancer or cell line (Neuro tumors) 28 32 35 50 81 91 102 110 115 124 133 155 160 219 245 299 355 Renal tissue (NCI60) 362 Renal tissue (Neuro tumors) 28 32 35 50 81 91 102 110 115 124 133 155 160 219 245 299 355 Renal tissue (Various tumors) 18 78 197 308 S. aureus stimulated immune cells (Stimulated PBMC) 358 Serum response in epithelial cells (Fibroblast serum*) 432 Skin fibroblasts (Fibroblast EWS-FLI*) 90 94 104 125 158 181 196 242 244 283 303 315 320 372 379 438 485 Skin fibroblasts (Fibroblast infection*) 458 Skin fibroblasts (Fibroblast serum*) 229 318 432 509 Slow doubling (60-80) cell lines (NCI60) 345 436 Small cell lung cancer (Lung cancer) 54 57 98 113 124 125 158 174 196 197 198 212 241 252 253 291 320 321 327 372 397 403 451 462 Squamous cell lung cancer (Lung cancer) 32 45 46 58 64 68 101 130 132 139 153 154 180 199 259 297 298 310 357 486 Stage T1 (Lung cancer) 38 92 94 107 204 342 382 385 426 Stage T2 (Lung cancer) 2 9 33 48 95 112 163 176 180 324 342 Stimulated B cells (B lymphoma) 37 69 79 128 136 168 169 170 179 222 255 272 317 378 397 430 459 532 Stimulated immune cells (Stimulated PBMC*) 5 31 37 46 61 64 69 75 76 79 84 92 97 108 119 121 123 126 128 136 169 170 171 174 179 182 208 210 219 223 237 241 254 255 261 263 291 292 300 301 303 308 312 317 345 358 367 371 375 378 399 433 436 439 456 459 481 488 521 522 525 532 537 544 562 T cells (B lymphoma) 60 97 119 156 182 204 240 261 277 292 313 345 358 430 525 547 T cells (Leukemia) 173 489 T cells (Various tumors) 158 385 403 426 474 Toxoplasma infected skin fibroblasts (Fibroblast infection*) 55 88 537 Unstimulated immune cells (Stimulated PBMC) 12 92 121 123 169 254 300 312 433 456 488 521 537 Vincristine chemotherapy (Neuro tumors) 5 19 44 60 324 Wild type p53 tumor (Breast cancer) 54 118